在細胞克隆中，對培養的細胞來說，從原有的克隆中，再篩選出具有某種特性的細胞進行培養，就是亞克隆。
在分子克隆中，從大片段的克隆中選取特定小片段再克隆。
亞克隆就是初步克隆的外源片段往往較長，含有許多目的基因片段以外的DNA片段，將目的基因所對應的一小段DNA找出來。
對已經獲得的目的DNA片段進行重新克隆，其目的在于對目的DNA進行進一步分析，或者進行重組改造等。
基本過程包括：
(1)目的DNA片段和載體的制備；
(2)目的DNA片段和載體的連接；
(3)連接產物的轉化；
(4)重組子篩選。
技術：限制性內切酶是一類能識別雙鏈DNA分子中特異核苷酸序列的DNA水解酶，該類酶是體外剪切基因片段的重要工具。
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